如果你的网站域名已经被100个主体的小程序绑定，那么你就无法再将该域名绑定到其他的小程序上。这可能会给开发者和企业带来一定的困扰，因为他们可能需要使用该域名来开发新的小程序，或者将已有的小程序从一个主体转移到另一个主体。
在这种情况下，你可以采取以下几种方法来解决问题：
1. 申请更多的域名
如果你需要绑定更多的小程序，你可以考虑申请更多的域名。你可以向域名注册商申请新的域名，并将其用于新的小程序开发或主体转移。虽然这可能会导致一些额外的成本和管理问题，但它可以让你继续开发你的小程序，而不必受到域名绑定数量限制的影响。
2. 将小程序转移到其他主体名下
如果你需要将已有的小程序转移到其他主体名下，你可以联系原主体，请求他们将该小程序从他们的主体名下转移到你的主体名下。这需要原主体同意并进行相关操作，因此需要跟原主体进行协商。需要注意的是，如果原主体已绑定了100个小程序，他们可能无法再绑定其他小程序，因此你需要考虑他们的实际情况。
3. 与其他小程序进行合作
如果你需要开发新的小程序，但已经无法绑定现有的域名，你可以考虑与其他小程序进行合作。你可以与其他小程序合作，共享一个域名，以便你们都可以使用该域名来开发小程序。需要注意的是，这需要与其他小程序进行协商，并确保你们的合作符合相关法律法规。
总的来说，如果你的域名已经被100个主体的小程序绑定，你可以申请更多的域名，将小程序转移到其他主体名下，或者与其他小程序进行合作。这需要根据你的实际情况进行选择，并需要与其他人进行协商。同时，需要注意保护自己的合法权益，遵守相关法律法规，以免出现纠纷。